正午好时光

中午的时光，在临近春天的时候变得更加好。最近一周的天气总是在中午的时候阴暗一点，太阳时不时的偷懒躲在云层里。但风已不再那么寒冷，春天的脚步更加的近了。

中午吃饭的时候，对着一米的阳光，看着四周大厅里我们和American们吃着不同的饭，我们讲我们熟悉的中文，他们讲英文。不同之处是他们听不懂我们的中文，我们可以揣测出他们谈的东西。

时不时在脑子里想很多东西：

• 中国的科研体制好，还是美国的好？
• 中国能否在未来的20年里在科研上赶超美国，又一次当代版的大跃进。
• Greed is good!

最后一句话是一个周前的一次seminar，讨论怎么做科研的，包括写grants，与人交流，科研生涯的设计，如此种种。教授的这句话是唯一的收获吧。用中文的话说，没有最狠，只有更狠。

有人说男人之间的谈心，谈的理想和事业心；这个和女人间的谈心有本质的区别。同时，也会设想，如果我做为老板怎么去教育自己的学生云云，如果我重新做回本科生，怎么去设计自己的4年或者5年的时间。

春节已经过去。确实没有给几个国内的朋友打电话。步入30后我们已经追求不同的生活，也再难找到同路而行的老友，每个人在自己预定或者设想的轨道上有条不紊的运行，脱离轨道，出轨的结果是很严重的。

不过，春天又来了，在QQ签名上说，春节给自己最好的礼物，是找寻未知，发现精彩，充实自己，得到收获。

“看一个老师的博文说，新年给自己最好的礼物就是去自己没有去过的地方，发现未知的世界，寻找其中的自己。把这句话送给微博的朋友们，祝大家兔年吉祥，快乐。新的一年你不一定会去新的地方，但生活中肯定有很多未知，很多惊喜，一年下来就有沉甸甸的收获。”

Loving the life we live

还有半年多，就要离开熟悉的校园，开始工作了。即便是此时，好多像我一样要离开大学的人对社会的了解还是不多的。对自己的人生选择亦是不明确，找不到人生的方向。我们总是在羡慕别人找到一份满意的工作，不一定是喜欢的，却不能给出自己的答案。果真如徐大美女说的，“工作找个自己喜欢的”。

问题是你有足够的勇气跳槽吗？黄健翔的跳槽炒作的风风火火的。我当时就有怀疑，他凭什么一年有所谓的几千万的身价，离开了央视就能有新的东家，从凤凰台被炒，更不看好他的钱途了。直到07年春节，看到了山东台和其他频道上的ESPN的联播平台，就想，这里应该有他的位子吧。从今年开始，欧洲杯更想看他的评球，在网上的TV直播中也能找到他，而且还有杂志，电视台的走穴等等，走出央视，也别有一片天空。当初是看走了眼。

上周一个中科院的老师过来作报告说，出国之后从来没有想过回来，但是4年前回国后，现在学术上崭露头角，开创了一个研究室，做很好的研究。我想，工作是从来不愁的。关键是你有没有准备好，合适某个岗位，找到自己的位置，确立好自己的方向。

自信的人（自诩的），或者说乐观的人，总是会被一些事故的言论惊出一身冷汗。直到看到丽丽老师的QQ空间中的帖子。我相信不是她写的，可能是总哪里转载来的。或者是王希军写的，对，就是他一贯的笔调。

也借此反省一下：

1.学习是不够的。从上研究生开始就不怎么主动的学习了。本科时多么的上进都是千秋古史了。文献没看几篇，聊天的时候却可以夸夸而谈的吹嘘一下。看书是有必要的，同时少上网，多看文献。英语学习也只限于文献学习了，一举两得，多啃些文献，加强学习。
2.工作还是不用愁的。只要你找准自己的方向，努力的完善自己，并为了这个目标坚定不移的努力。

3.老师和学生的关系。老师和学生的关系是很微妙的。本科时的老师大都是不那么令人喜欢的。我记得在莱农林书记对我说的一句话是：“今天你以莱农为荣，明天莱农以你为荣” 。为我们灌输的永远是莱农这么美好，你们怎么没有发现美的眼睛呢…… 一定要有，没有也要变出来。在前不久的和大学老师的聚会上，听老师们讲，我们都是洗耳恭听，还是老样子。老师就不能听听学生的声音吗？不可能的，那个氛围我现在想起来也不寒而栗。我当然也不是否认过去，肯定现在，不过人都在向前走，回首过去，总是有比较的吧。一比较，我就想起和“你所不知道的事”相同风格的一个老师，他说兽医的人没有当官的，我们当时都不服气。事实上，这位鼠目寸光的老师，看看吧，东农的校长是兽医的，川农的校长是兽医的，如果那位校友见到王老师，一定要转告他。

现在看和老师的关系。我更愿意占到老师的角度上。文革时期老师是“臭老九”，没钱没有地位，现在的情况就诸如文中所言吧。“蜡炬成灰泪始干”本来是形容爱情的，被借来形容老师本身就是不匹配的。金钱的诱惑对人都是有的。我等又何尝不是呢？不管是“商化”还是“官化”都是无可厚非的。人分九等，老师们中间有谦谦君子，也有卑鄙小人。


校园的爱情不也非常美好吗，我们的同学中有如此的伴侣也证明了这一点。只要心中有爱，追逐吾爱，工作，爱情，事业都会美好的。

Living the life we love, loving the life we live.
活好当下！

单分子DNA测序仪

之前就看到DNA测序技术改进的文章，在science&nature上的报道，后来没有关注就不记得了。直到看到Helicos公司在youtube上的视频后，对这项技术有了认识。相关的一些报道，对单分子DNA测序的再研发进行了报道，从最初的读5个碱基改进读25bp。从事生物科学天才的冒险家对技术不止的追求和商业应用的完美结合必将测序技术载入一个新的时代。

图示测序步骤：（图片太大，点击在新窗口看大图）



还有一个疑惑的问题，就是如何将25-30bp的片段拼接起来。在Helicos网站上介绍开发了一种称为“ dynamic programming alignment tools”的软件优化单分子DNA测序的结果。为了提高对测序结果拼接的灵活性，该软件采用三种算法：Needleman-Wunsch，Smith-Waterman和A “hybrid” type combining features of global and local alignment schemes。

与现在ABI3730比较，测序公司30-50元/反应收费，一般要3-5天收到测序结果。在技术层面上划时代的进步，其商业应用的前景也十分看好。但一台仪器135万US dollar非常昂贵。

Science上的全文链接：
http://www.sciencemag.org/cgi/content/full/320/5872/106?ijkey=2qQYHiFdcAKLU&keytype=ref&siteid=sci

Helicos High Speed Gene Sequencing的视频：



科学网的报道：

美国Helicos BioSciences公司研究人员近日称，他们开发出了一种新型的测序设备——单分子DNA测序仪（single-molecule DNA sequencers）。该仪器能够“阅读”单分子DNA的单个碱基。相关研究文章发表在4月4日的《科学》（Science）上。

传统上，在测序之前，要先对DNA链进行扩增。这一过程往往会引入错误，并且对某些DNA片断来说无法很好地实现，从而使得对整个基因组进行测序变得尤为困难。

Helicos BioSciences公司以病毒M13为实验对象，首先将它的基因组截成小的片断，用一种酶将短小DNA标签附于每个片断的末端，在适当的位置锚定 DNA片断。之后加入DNA复制酶和带有荧光标签的碱基或碱基对。当荧光DNA形成链时，就用相机拍下每个新加上的碱基对。

这一新方法称为“合成测序”，原则上与其它一些方法相同。不同之处在于，其它一些方法需要同时测序数千个相同的基因组片断以使信号足够“明亮”，新方法能够侦测到单个碱基的荧光。

新方法避开了繁琐的扩增过程，将能大大降低测序的时间和成本。Helicos BioSciences公司估计，新仪器能够用8周的时间测序一个人的基因组，代价是7万2000美元，而仪器本身则价值135万美元。

美国能源部联合基因组研究所主任Edward Rubin说：“这太酷了！最终，单分子测序将成为通行的方法。”

新的发现无疑又朝着1000美元/人的宏伟基因组测序计划迈近了坚实的一步。论文第一作者Timothy Harris认为，这一目标将会在5年以内实现。（科学网 梅进/编译）

（《科学》（Science），Vol. 320. no. 5872, pp. 106 – 109，Timothy D. Harris，Zheng Xie）

绳头小利

在财经网站的某个页面上有下面的一副图片，配的标题是“绳头小利”

从图片的来源是俄罗斯的漫画。我就把它当作今年的中超联赛说事吧。
可怜的申花终于成就了包括我在内的很多人的估计：这个赛季朱骏的球队拿不了中超冠军。从过程来看，申花在最后一场比赛还是有很大的领先优势；鲁能则是大难不死，广州队也有意放他一码（某些广州球迷，如小黄之流的判断）。

这个事情终于告一段落，我晦气的十一月也终究过去了。

11月发生了好多事，来不及记录，思考……

一个人的胜利

一个人的胜利

评申花和鲁能的比赛

我没有看这两支球队的比赛。甚至比赛的消息也不知道。在看新浪新闻时看到了

结果和各大媒体的评论。到目前为止，今年鲁能一共输了两场比赛，分别是对阵

广州和申花。对阵广州的比赛错过了去现场看的机会。

在鲁能集团接手后，鲁能财大气粗，开始引入本土和国外的优秀球员，请诸如桑

尼、涅波、图拔等优秀的教练。整体实力有了长足的进步。在国内联赛中也跻身

三甲之列。1999年的双冠王的骄人战迹也令人无限回味。

最近几年的鲁能与申花的比赛场场都是强强对话。昔日1:5大比分输给申花让鲁能

蒙羞。好似对于N多年前的大连，让鲁能队员有点发怵。

大学毕业之后就没有看比赛的习惯了，即使现在的网络直播也非常方便。在足球

的大环境日益恶化的中国，我宁愿去看女排的比赛。高妹、靓妹和女排精神的鼓

舞看起来更过瘾。

再回来说这场比赛。申花的老板已经把整个球队强奸了。这个比赛的胜利是他买

一个人的胜利。单从比赛的结果看，申花赢得了机会减少了与鲁能的差距，保留

了夺冠的悬念。从昔日的5比1狂屠鲁能，到今朝好事又重来。外行人管理内行人

，一切以胜利和奖金为标杆，同样财大气粗的鲁能稍逊风骚。以我为中心，你李

大头不听说就“out”，杜队长听话就“pass”。从这个角度上讲，朱老板是明白人。

足球场上没有以人为本，没有足球规律，只要按我的想法去做，我们就是战无不

胜的。

用申花球员的话讲，用合理犯规终保住胜利果实。胜利来之不易。也就是说申花

合理使用了规则。可以想到的是，在球场上，申花的球员用10黄1红来换取3分。

由于武汉的退出，在接下来的比赛中，申花对武汉的比赛自动判3:0，而且球员的

红黄牌也不影响后面的比赛。上半场申花的主动进攻让鲁能大失颜面，3:0领先。

我想这之后的场面就有些难看了。主动要黄牌，一碰就倒，合理利用规则。只能

说踢了半场好球，3球领先，让人生畏；但也会让人冷嘲热讽对于体育精神的缺失

。正如鲁能的球员所说“见过不要脸的，但没有见过这么不要脸的！”。这个比赛的

3分获得是理直气壮的，没有太多可以挑剔的地方，但有些过激的行为对申花的质

疑，这似乎是值得思考的问题。

申花的球员讲“首先郜林对本场比赛发表了自己的看法，他认为比赛踢得很艰苦，

能坚持下来很不容易”，又说，“郜林认为这并非是因为申花球员故意踢“暴力足球”

。而是因为比赛本身太激烈了，因此申花球员在必要的情况下采取了合理的犯规

战术，而也正是这样的战术帮助球队取得了胜利”。

同时，鲁能的输球也是在我们在反问鲁能一个问题，球队的核心是谁？
宿茂瑧、李霄鹏、郑智，之后谁能提当这个大任呢？


两个小花絮：

图拔：这简直就是一场杂耍 申花损害中国足球形象

http://sports.sina.com.cn/j/2008-10-19/12134018370.shtml

揭秘申花赢球反遭质疑 助教场边大喊：快铲人啊!

http://sports.sina.com.cn/j/2008-10-19/19004018999.shtml

博士无假期

自研究生以来就有了五一和国庆两个假。但有记载以来，还没有停下来过节。

如同蜗牛般的前进，但实验还是有点进展，着实非常的欣慰。 而且这段时间总在停滞的状态。好多东西没有到位，直能从手头上有的先入手。于浑浑噩噩中晚上到迷上了007和prison break。也有实验室倍受追捧的TVB《溏心风暴之家好月圆》。突然想好好学习一下口语，把subtitle文件找出来听一下，pb口语化的 很，Miachel的话有些听不明白。

上次艾博回来之后，教师节，新生入学之后，很多很多都没有及时更新就渐渐忘却了。最可笑的是党会上的批评与自我批评。简直就是一个内心表白：博士的最后一年怎么过呢？

不经意间总会听到一些好消息和坏消息：

• 美 国的次贷危机带来的金融危机，小布什计划拿出四位数亿的钱来买单。可是有人不答应。说是纳税人的钱云云。不过，觉得是幌子，不幸是猜中了。第二轮投票就通 过，闪电式sign。全球经济不景气，不知道到对要出国的人来说是不是无路可走了。zpmm说美高校在消减开支，机会不多了。不过都不急，时间还来得及。
• 神七飞天是中国的骄傲。在空间中的一小步却是中国人的大跨步。正如那个美国专栏作家说的，21世纪的几年，美国忙着反恐战争，而中国却一心扑在经济发展上。奥运会，神七……
• 三 聚氰胺的问题让食品安全蒙上阴影。让中国的最低阶层的奶农倍受打击。让国人对国内的生产奶粉的厂家嗤之以鼻。蒙牛、伊利、三元等多个厂家都有三聚氰胺超 标。我们最亲身的体验，就是华农酸奶是用最差级别的三元奶粉作的，超标。sanlu的行为就更令人发指。幸好妹妹的小孩喝sanlu的奶粉无事。如果我看 到去年美国宠物狗粮中检测出三聚氰胺超标，我也凭着职业的敏感说不久的将来在产地国也会发生类似的事情。如果我们仅仅凭着良心去拷问这些人，还是远远不够 的。Marks在几百年前就说，“如果有10%的利润，它就保证到处被使用；有20%的利润，它就活跃起来；有50%的利润，它就铤而走险；为了100%的利润，它就敢践踏一切人间法律；有300%的利润，它就敢犯任何罪行甚至冒上绞架的危险” 这些人足够杀几百回。
• CURSE。呵呵，难得有人说这样的话一回。不管是C，还是anti-C。想来都是一件有意义的事。最开心的事就是在实验室大家一起吃自助了。下次要吃小肥羊了。

计划好时间，充实过好每一天。

还有花多点时间来blog

精美的图片来自于专业的不卸追求。

业精于勤，而荒于嬉！

blogger come back!

good news for coming back!

but I wait for so long time!

旧话重提-读书

好久没有在blog里写东西，并不是因为太忙。倒是有些话并不是很好在这里写出来。
期间，有一个人去科技楼自修，重新体会从本科以来学习的情景。虽然教室里没有几个人，但是很难有人有定力去花一个晚上的时间去看书。很多人的心是浮躁的，静不下来的。而每每做到科室的时候还是充实的享受的。
上个月听俞敏洪讲座的时候。提到王强是如何喜欢书，即使在中年的时候还不是推荐给他好书看，给他阅读的好习惯。王强则在演讲中大谈逻辑之美，鬼使神差的把英语的语言与计算机语言结合在一起。着实让人羡慕一番。更有甚者，在听过之后，马上在图书馆借了黑格尔的哲学书，寻找逻辑的哲学本质。
前面的文章中也提到了看书。今年看的最多的还是传记。朱可夫，崔可夫回忆录，陈赓大将，还有最近正在看的Bill Cliton的My Life。这些作品仿佛是把名人的人生经历重现，在关键的时刻作者如何取舍，以及对此后人生的影响，作者的思考。诸如此类都很有收获。
书实际上离我们的生活越来越远。有了电脑泛读的机会多了，但是静下来品味书香的机会少了。甚至有的学者认为如此会导致人文精神的缺失，我对这点倒不是很怀疑。在新东方的《书之爱》一期中一位博导曾经讲研究生一年要读70-80本左右的书，要有一半的书要通读。书籍越来越多，但我们离此目标相差甚远。
而且，我觉得不仅要看书。更要和别人交流书里的东西。那些东西会鼓舞我们的斗志，点亮我们的生活，增强信心。。。。。。还是要和别人吹水的。此间，人物形象栩栩如生，仿佛刚刚发生过。举个例子，比方说你背mm走一段路的时候，妹妹说：“快把‘师兄’放下来”你都不知道是何意的时候，就要补课了。:)
克林顿在自传中反复提到这样一句话：“一个人的生活不仅仅是由你接受了什么样的机会造成的，往往还是由你放弃了什么样的机会造成的”，在竞选国会议员失败的时候没有去选择轻松的职业，在竞选州长失败的时候没有去华盛顿，与其说是执着的放弃某些机会，还不如说是一种对追求的坚持。机会有时想陷阱，放弃他才至于我们不会偏离人生轨迹。还有一句也非常好：“我们行善，不可丧志，若不灰心，到了时候就要收成。”当时，作为阿肯色州长的他正在努力为一个失业率高达25%的县引进一个新项目。但在最后时刻，内布拉斯加州提出给该公司追加100万美元的收入，抢走了这个项目。他倍受打击，但看到这句话时又重新工作。名人如此，何况我等，时时被困难困扰，唯有坚信自己，诚实努力，方有收成。
我也用这句话来自励，在最困难的时候，不失信心，继续努力，期待收成。
这句话出自《加拉太书》第六章第九节，英文写的很美，大家一起欣赏！
Let us do not grow weary while doing good,
in due season we will reap if we do not lose heart.
以上的作为近期读书的收获，重拾信心，努力向前！

钱和银行

开学了，有和钱有了很多的联系。这个阶段，是体现现代化教育产业化成绩的时候。学校收了越来越多的学生，也有越来越多的学费住宿费收取。为了收到学生手中的钱，学校也不择手段的诈骗、恐吓。就像上次的搬家一样，集体大动员。动不动就不给注册~
教师节的时候就感觉到学生如此之多。在专家楼吃饭两大桌足有20多人。对于老师，是桃李满天下。可是对在读的学生是很大的考验，实验室寸大的地方被大家蚕食。教育产业化的恶果让每个上学的深恶痛绝，隐忍求生。
在中国银行取款的人在叫号后漫长的等待。三个窗口慢慢的如同蚂蚁般向前走着，一个小时20位。足足等了4个小时，终于取到了钱。Just before in my turn, 突然有个人插入到我前面。当时，手里拿着中国银行的存折，在这个当口，用手机计算这个帐户有多少钱。
想来这个帐户还是非常值得纪念的。05年去北京出差前开了一个帐号。那次北京之行是弃前的；06年Scopus兼职中，美元就是汇入到这个帐户中。7个月中绞尽脑汁的和xiaotang，xiaojiang去推广scopus活动，在兴奋和享受中满怀激情，讨论，写汇报，布置活动，在图书馆举办讲座。着实充实和快乐的日子，也有丰厚的回报。但也有中国银行的卡经常的被消磁，在漫长的等待中也就放弃它。大家有一个共识，就是银行不需要忠实的客户，中国大把的就是不缺人，有很多的客户选择。
07年是和BOC说byebye的时候了。
远远没有到回忆的年龄，也不缺少去新生活的勇气。想到如此种种，总给我信心百倍，充实的快乐。
Tomorrow is another day.
Life is like a box of chocolate, you never know what you want to get.